Nem házasodtak össze partnerével - Boszorkány is van a felmenői között: 10 ámulatba ejtő tény Margaret Atwoodról

Az művésznő Graeme Gibson regényíróval él együtt.  Bár élettársával nem házasok, de van egy lányuk, Eleanor 'Jess' Atwood Gibson, aki 1976-ban született. Továbbá az írónőnek két unokája is van.